Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms