Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1DQ9Y2S0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms