Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms