Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVW-1Q9UQF0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms