Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS5Q9UPZ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms