Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX12Q9UMY4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms