Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRIP2Q9ULQ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP2Q9ULQ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms