Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ERG28Q9UKR5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERG28Q9UKR5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms