Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP8AP2Q9UKL3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP8AP2Q9UKL3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms