Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms