Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAX2Q9UIW0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms