Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms