Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTRF1LQ9UGC7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTRF1LQ9UGC7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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