Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms