Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms