Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK4Q9UBT3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK4Q9UBT3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK4Q9UBT3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK4Q9UBT3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK4Q9UBT3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK4Q9UBT3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK4Q9UBT3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK4Q9UBT3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK4Q9UBT3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK4Q9UBT3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK4Q9UBT3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK4Q9UBT3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK4Q9UBT3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms