Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFIP11Q9UBB9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms