Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARHGAP28Q9P2N2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms