Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms