Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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