Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms