Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms