Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS1Q9NYS0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms