Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms