Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMPD3Q9NY59 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms