Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms