Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms