Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms