Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCM2LQ9NUG4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms