Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms