Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms