Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms