Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms