Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO6Q9NRD1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms