Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms