Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLCO1B3Q9NPD5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLCO1B3Q9NPD5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLCO1B3Q9NPD5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLCO1B3Q9NPD5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLCO1B3Q9NPD5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms