Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOPCQ9HD26 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms