Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms