Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC52A2Q9HAB3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC52A2Q9HAB3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms