Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP3Q9H6T3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms