Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf49Q9H6J7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms