Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC4Q9H6D8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms