Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PARLQ9H300 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PARLQ9H300 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PARLQ9H300 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PARLQ9H300 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PARLQ9H300 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms