Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MIXL1Q9H2W2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MIXL1Q9H2W2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MIXL1Q9H2W2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MIXL1Q9H2W2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms