Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH6AQ9H0K4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH6AQ9H0K4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms