Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NYXQ9GZU5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NYXQ9GZU5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms