Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms