Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC3H12CQ9C0D7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZC3H12CQ9C0D7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms