Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms