Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT23Q9C075 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT23Q9C075 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms